Lucas AUBERT
Membre étudiant 2e cycle
Concordia
Biologie
7141, rue Sherbrooke Ouest
, Montréal
(Québec)
H4B 1R6
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Domaine·s de recherche
- Transcriptomique spatiale
- Biologie pulmonaire
- Bioinformatique
- Génomique computationnelle
- Hétérogénéité cellulaire et tissulaire
Université
Concordia
Axe primaire du Réseau AIRS
Déterminants omiques et biologiques de la santé
Axe(s) secondaire(s)
axe2
Secteur·s de recherche
- Santé
Type·s de recherche
- Fondamentale
- Translationnelle
- Computationnelle/Bioinformatique
Diplôme·s
- B.Sc
- M.Sc
Travaux de recherche
Mes travaux portent sur l’utilisation de méthodes computationnelles et de données omiques pour caractériser l’organisation cellulaire et moléculaire des tissus humains. Dans le cadre d’un projet de transcriptomique spatiale pulmonaire, j’analyse des données Visium afin d’identifier les principaux types cellulaires et de distinguer...
Mes travaux portent sur l’utilisation de méthodes computationnelles et de données omiques pour caractériser l’organisation cellulaire et moléculaire des tissus humains. Dans le cadre d’un projet de transcriptomique spatiale pulmonaire, j’analyse des données Visium afin d’identifier les principaux types cellulaires et de distinguer les différentes structures et couches anatomiques présentes dans le tissu pulmonaire. Je compare notamment plusieurs approches de décomposition et de regroupement spatial, dont STdeconvolve, BANKSY et Seurat, afin d’évaluer la robustesse des annotations obtenues. Ces travaux visent à mieux comprendre l’hétérogénéité spatiale du poumon et à développer des méthodes reproductibles pour l’analyse de tissus respiratoires complexes.